⚙️ 软件与仿真导读
欢迎来到软件工具箱!器官芯片不仅是一个生物学实验平台,更是一个微缩的跨学科工程系统。得心应手的数字与虚拟工程工具将贯穿从微器件制备到数据自动分析的全流程。
在这里,我们记录和沉淀了实验流程中用到的各种辅助软件及使用范例。
1. 结构与制图 (CAD & Design)
工欲善其事,必先绘其图:
- AutoCAD / AutoCAD LT:用于 2D 光刻掩膜版的设计排版。
- SolidWorks / Fusion 360:用于 3D 打印模具(如微缩培养室、泵阀外壳)的宏观结构设计。
2. 仿真与多物理场 (Simulation)
不要盲猜结果,让计算机提前验证:
- COMSOL Multiphysics 操作指南:
- 微流控层流流场仿真:计算微通道内的剪切力。
- 化学组分传递仿真:模拟扩散和多孔滤膜之间的溶质交换。
- 氧气浓度梯度验证。
3. 图像与数据分析 (Data Analysis)
数据的高质量处理和可视化呈现:
- ImageJ/Fiji 高级技巧:如何批量统计细胞数、对荧光图像进行对齐与伪彩合成、以及输出显微光切面的侧视图。
- Python 数据预处理:结合前述的电生理和阻抗读数进行过滤、降噪绘图和聚类的简单脚本思路(部分结合 Colab 源码内容)。
请通过左侧边栏深入了解各章节的具体使用指南。