知识库总览
欢迎来到 Anke Lab Wiki —— 器官芯片小组的科研知识库。
这里不是普通的文档站，而是课题组长期维护的可复用、可检索、可传承的知识沉淀平台。任何一位新成员都可以通过这里快速上手实验操作、软件工具和论文作图规范。
这个知识库解决了什么问题
组内科研工作涉及多个环节：实验操作、数据处理、软件仿真、论文作图。过去这些知识分散在个人电脑、微信记录和笔记本里，难以复用和传承。
现在，我们把以下内容集中管理：
- 实验 SOP：标准操作流程，每一步都有记录，可复现、可优化
- 理论文档：器官芯片设计原理、微流控基础、材料特性说明
- 软件教程：COMSOL、ImageJ、CAD、Python 等工具的使用指南
- 代码工具：Colab 笔记本、统计分析脚本、图像处理代码
- 作图规范：论文 Figure 的设计原则、配色、字体、导出格式
- 组内资源：常用链接、投稿信息、仪器预约等公共信息
知识库结构
芯片设计与理论
理解微流控原理是设计器官芯片的前提。本板块覆盖：
- 层流与雷诺数、流体剪切力计算
- 浓度梯度生成机制
- PDMS 材料特性与改性
- 器官芯片发展史与经典架构
适合：刚开始接触器官芯片设计的研究生，需要查阅理论公式和设计原则。
湿实验 SOP
从光刻到细胞培养的完整操作手册。每条 SOP 都来自实际实验经验，包含关键参数、常见问题和避坑提示。
当前已收录：
- 细胞传代标准操作规程
- 细胞免疫荧光染色流程
计划补充：软光刻操作 SOP、PDMS 倒模与键合、微通道表面改性、细胞接种技巧、气泡排除方案。
数据分析与 AI
从零开始学习用 Python 处理实验数据。覆盖从环境配置到深度学习的一整套科研编程教程。
当前已收录：
- 编程入门（7 篇）：Python 概念、Miniconda 安装、Conda 环境管理、VS Code 配置、常见错误排查
- Colab 零基础指南：Google Colab 的环境配置与基础操作
- CNN 入门教学：面向一维电信号分类的深度学习入门
- Colorbar 绘制与 SVG 导出：Matplotlib 自定义颜色条的论文级导出
- P 值计算：基于 scipy 的独立样本 t 检验
软件与仿真
器官芯片研究中常用的工程软件教程。
当前已收录：
- COMSOL 仿真入门：从几何建模到壁面剪切力提取的完整流程
计划补充：AutoCAD 掩膜版设计、ImageJ/Fiji 图像批量处理、SolidWorks 3D 打印模具设计。
论文作图规范
统一课题组论文 Figure 的视觉标准。减少投稿前反复修改格式的时间。
内容包括：
- 配色方案（色盲友好、perceptually uniform colormap）
- 字体与字号规范（Arial / Helvetica，单栏 85 mm / 双栏 178 mm）
- 矢量图导出（SVG / PDF）
- 统计标注规范（* / ** / *** + 图注说明）
- 常见期刊投稿图片格式要求
组内资源
课题组日常所需的公共信息。
- 常用数据库链接（PubMed、Google Scholar、Web of Science）
- 合作作者投稿邮箱及单位
- 期刊分区与投稿方向速查
- 实验室仪器预约
快速开始
如果你是新人，建议按以下顺序浏览：
| 步骤 | 做什么 | 预计时间 |
|---|---|---|
| 1 | 浏览本页，了解知识库整体结构 | 5 分钟 |
| 2 | 阅读 编程入门 的导读页 | 10 分钟 |
| 3 | 阅读 湿实验 SOP 了解实验流程 | 20 分钟 |
| 4 | 根据当前课题需要，深入具体板块 | — |
如何贡献
本知识库基于 Markdown 编写，修改方便。如果你：
- 跑通了一个新的实验 Protocol
- 发现现有 SOP 中有可优化的参数
- 学到了新的软件技巧
- 投稿时踩了新的作图格式坑
欢迎在对应板块新建或编辑文档。所有内容都可以通过 Git 追溯历史版本。
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Markdown 语法简单直观，不需要任何编程知识。可以参考已有页面的格式创建新页面。